Описание
Описание Комплект поставки: генетический анализатор 3500, 8-капиллярный блок, реактивы и расходные материалы для квалификационных испытаний, управляющий компьютер с установленной программой управления и сбора данных и анализа. Расходные материалы и наборы для проведения анализа — по запросу. Секвенирование нуклеиновых кислот — это определение их первичной нуклеотидной последовательности. Некоторые задачи генетического анализа: расшифровка абсолютно неизвестных последовательностей ДНК, например, генома какого-нибудь нового вида (секвенирование «de novo»); обнаружение индивидуальных отличий конкретного образца от обобщенной последовательности, которая в общих чертах уже известна (ресеквенирование); анализ генетических полиморфизмов, включая однонуклеотидные (SNP-типирование); анализ эпигенетических модификаций ДНК, например профиля метилирования; анализ профиля экспрессии отдельных клеток секвенированием кДНК, полученной из тотальной мРНК клетки, например, для диагностики вирусных и раковых заболеваний и др. Методы секвенирования. «Классический» метод Сэнгера. Метод секвенирования НК путем «обрыва цепи» (Ф.Сэнгер) основан на синтезе новой ДНК-цепи на анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера и смеси дезоксинуклеотидтрифосфатов (dATP, dGTP, dCTP, dTTP) и на случайном обрыве синтезируемой цепи при встраивании одного из меченных разными флуоресцентными красителями дидезоксинуклеотидов (ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP). Поскольку «обрыв цепи» происходит статистически, то получается весь набор ДНК-фрагментов, отличающихся между собой по длине всего на один нуклеотид. Затем полученная смесь ДНК-фрагментов обрабатывается формамидом для расхождения цепей и подвергается капиллярному электрофорезу в полиакриламидном геле, в результате чего фрагменты распределяются по длине. Сканирование лазером, возбуждающим флуоресценцию красителей, которыми были помечены дидезоксинуклеотидфосфаты, позволяет определить последовательность нуклеотидов исходной молекул
